Rebus air sampai mendidih, masukkan sagu mutiara dan masak sampai matang (sampai tidak ada tititik-titik putih di sagu mutiara). Bisa menambahkan pewarna merah sesuai selera (opsional).

Setelah sagu mutiara matang, bilas sagu mutiara dengan air matang dan tiriskan. Olesi cetakan kue (cetakan jasmine uk. dia. 6.5 cm) dengan minyak goreng, sisihkan.

Campur semua bahan kering, aduk rata. Tambahkan santan, aduk rata sampai gula larut.

Bagi adonan menjadi 2 bagian. Tambahkan sagu mutiara ke salah satu adonan. Sisihkan sisa 1 bagian adonan lainnya. Panaskan kukusan sampai air mendidh dan uap air banyak.

Tuang sebagian adonan putih ke dalam cetakan lalu kukus selama 3 menit. Setelah itu tambahkan adonan yang telah diberi sagu mutiara sampai 3/4 cetakan saja.

Kukus selama 3 menit. Jangan lupa bungkus tutup kukusan dengan lap bersih supaya air tidak menetes ke kue. Ambil sisa adonan putih, bagi menjadi 2 bagian. 1 bagian tetap putih dan 1 bagian sisanya diberi pasta pandan. Tuang adonan putih ke atas adonan sagu mutiara, kukus lagi selama 5 menit.

Tuang adonan pandan ke atas adonan putih lalu kukus lagi selama 5 menit atau sampai matang. Setelah matang, diamkan kue Nagasari sampai suhu ruang, setelah dingin baru keluarkan kue dari cetakan dan hidangkan. Selamat menikmati.