Готуємо соус. Для цього розтоплюємо на сковорідці вершкове масло, додаємо муки та помішуємо секунд 40, щоб мука трохи підсмажилась. Відставляємо сковорідку в сторону. Окремо підігріваємо в мікрохвильовці молоко. Молоко та масляно-мучна суміш має бути однакової температури, щоб при їх з'єднанні не утворилися комочки. Вертаємо сковорідку на вогонь, та помішуючи інтенсивно вливаємо тепле молоко невеликими порціями. Даємо соусу прокипіти 3 хв.на середньому вогні.

Тим часом натерти сиру пармезан та моцарели твердої (не в росолі). Трохи пармезану залишити для посипки верхнього шару. Додаємо натертий сир до соусу. Перемішуємо та готуємо поки сир не розтопиться. Зняти соус з вогню, дати йому хвилин 5 охолонути. В мисці збити 2 яйця та додати їх в два прийоми до соусу, збиваючи вінчиком. Посолити соус за смаком та додати мускатного горіху. Накрити харчовою плівкою в контакт, щоб соус не покрився коркою.

Готуємо продукти для мусаки. Нарізаємо цибулю кубиками. Помідорки очищаємо від шкурки та теж нарізаємо кубиками. (Робимо надрізи навхрест зверху помідори. Занурюємо в кип'яток на 1 хв, потім до крижаної води та знімаємо шкурку)

Баклажани миємо та нарізаємо тонкими слайсами по довжині. Якщо баклажани гірчать, то солимо кожний слайс та ставимо їх в друшляк, щоб стік сік. Промиваємо та висушуємо.