Ξύνουμε τα κολοκυθάκια, να φύγει το εξωτερικό στρώμα της φλούδας τους. Τα τρίβουμε, τα σουρώνουμε και τα αλατίζουμε. Τα αφήνουμε στο σουρωτήρι για 30' περίπου να στραγγίσουν.

Μεταφέρουμε τα τριμμένα κολοκυθάκια σε ένα μπολ. Προσθέτουμε το κρεμμύδι, το ελαιόλαδο, το αυγό, τα τυριά, τα μυρωδικά και το αλεύρι. Αλατοπιπερώνουμε και ανακατεύουμε καλά, να έχουμε ένα ομογενές μείγμα. Αν δούμε ότι το μείγμα είναι υπερβολικά υγρό, προσθέτουμε λίγο ακόμη αλεύρι.

Σχηματίζουμε τους κεφτέδες και τους τοποθετούμε σε ταψί με λαδόκολλα. Το μείγμα βγαίνει σχετικά αραιό και κολλάει λίγο στα χέρια, μην σας ανησυχεί αν δεν παίρνει εύκολα σχήμα. Ψήνουμε σε προθερμασμένο φούρνο στις αντιστάσεις στους 200 βαθμούς για 25'-30'. Καταλαβαίνουμε ότι οι κεφτέδες είναι έτοιμοι όταν σταθεροποιηθούν και ροδίσουν καλά.