Ξεκινάμε με τη γέμιση. Σ'ένα τηγανάκι βάζουμε το μισό ελαιόλαδο και τσιγαρίζουμε 1/2 κρεμμύδι ψιλοκομμένο και τα δύο φρέσκα κρεμμυδάκια. Προσθέτουμε το ρύζι, αλάτι, πιπέρι και σβήνουμε με τον χυμό από το ένα λεμόνι. Προσθέτουμε λίγο ζεστό νερό και αφήνουμε το ρύζι να'απορροφήσει το νερό, τότε βάζουμε λίγο ακόμα νερό και συνεχίζουμε μέχρι το ρύζι να γίνει "αλ ντέντε". Στο τέλος προσθέτουμε και τα ψιλοκομμένα μυρωδικά, (όλο τον μαϊντανό, το δυόσμο και το μισό άνηθο).

Αφήνουμε τη γέμιση μερικά λεπτά στην άκρη να κρυώσει λίγο. Στο μεταξύ πλένουμε, καθαρίζουμε και κόβουμε σε κομμάτια τα κολοκυθάκια, την πατάτα, το καρότο και τα υπόλοιπα κρεμμύδια.

Γεμίζουμε τους κολοκυθοανθούς.

Σε μια κατσαρόλα τσιγαρίζουμε στο υπόλοιπο λάδι, το κρεμμύδι προσθέτουμε τα λαχανικά, αλάτι, πιπέρι, χυμό λεμονιού και ζεστό νερό. Ρίχνουμε τον υπόλοιπο άνηθο, δοκιμάζουμε για αλατοπίπερο και προσθέτουμε τους κολοκυθονθούς.

Αφήνουμε το φαγητό να σιγοβράσει μέχρι να γίνουν τα λαχανικά. Περίπου 30-40 λεπτά.