Προσθέτουμε αλάτι και πιπέρι, την ψιλοκομμένη ντομάτα και ακόμα ένα ξυλάκι κανέλας. Στη συνέχεια προσθέτουμε λίγο ζεστό νερό και αφήνουμε τον κιμά σε σιγανή φωτιά να μαγειρευτεί, για περίπου 1/2 ώρα. Πρέπει να έχει απορροφήσει όλα τα υγρά του πριν τον χρησιμοποιήσουμε για το παστίτσιο.

Μπεσαμέλ: Διαλύουμε καλά το αλεύρι στο γάλα, για να μη σβολιάσει η κρέμα και προσθέτουμε το αλάτι και τα 2 αυγά καλά χτυπημένα. Ανακατεύουμε την κρέμα σε μέτρια φωτιά μέχρι να πήξει. Στο σημείο αυτό προσθέτουμε το βούτυρο, το σπορέλαιο, την τριμμένη μυζήθρα και το μοσχοκάρυδο. Κατεβάζουμε από τη φωτιά και αφήνουμε για λίγο τη κρέμα να κρυώσει. Όταν είναι χλιαρή προσθέτουμε το γιαούρτι. Ανακατεύουμε καλά να ενσωματωθεί στα υπόλοιπα υλικά και η κρέμα μας είναι έτοιμη.

Απλώνουμε επάνω στον κιμά και τα υπόλοιπα ζυμαρικά και προσθέτουμε και πάλι τριμμένη μυζήθρα. Τέλος  προσθέτουμε την μπεσαμέλ την οποία απλώνουμε ομοιόμορφα, σκορπίζοντας στην επιφάνεια μικρές νιφάδες βουτύρου.