Ξεκινάμε φτιάχνοντας το σιρόπι. Βάζουμε την ζάχαρη, το νερό, τις φλούδες από το πορτοκάλι και την βανίλια να βράσουν για 8-9 λεπτά. Μόλις κατεβάσουμε από την φωτιά, ρίχνουμε το κονιάκ και το φρέσκο βούτυρο και ανακατεύουμε. Αφήνουμε το σιρόπι να κρυώσει.

Βάζουμε τα αυγά με την ζάχαρη στο μίξερ και τα χτυπάμε για 15 λεπτά μέχρι να φουσκώσουν, προσθέτουμε και τις 3 βανίλιες.

Σε μία κατσαρόλα βράζουμε το 1,5 λίτρο γάλα από το οποίο ρίχνουμε δύο ή τρείς κουτάλες μέσα στα χτυπημένα αυγά αυγά σιγά σιγά για ν΄ανεβάσουμε την θερμοκρασία τους(σαν να κάνω αβγολέμονο). Αφού αποσύρουμε το γάλα από την φωτιά, ρίχνουμε το μείγμα των αυγών μέσα στο γάλα και στην συνέχεια ρίχνουμε βροχηδόν το σιμιγδάλι, ανακατεύουμε καλά, προσθέτουμε τις 3κσ βούτυρο και βάζουμε σε χαμηλή φωτιά ανακατεύοντας μέχρι η κρέμα μας να πήξει και να κάνει φουσκάλες. Την αποσύρουμε και την αφήνουμε.

Λιώνουμε το υπόλοιπο βούτυρο και ρίχνουμε σταγόνες σε κάθε φύλλο με πινέλο. Βάζουμε τα μισά φύλλα κρούστας κάτω αφήνοντας περιθώριο γύρω γύρω στο ταψάκι, βάζουμε την κρέμα στην μέση, γυρνάμε τα φύλλα που περίσσεψαν και συμπληρώνουμε τα υπόλοιπα φύλλα βουτυρωμένα με τον ίδιο τρόπο από πάνω. Κόβουμε σε κομμάτια και ψήνουμε για 35 λεπτά σε προθερμασμένο φούρνο στους 180 βαθμούς.

Σοροπιάζουμε το ζεστό γαλακτομπούρεκο με το κρύο σιρόπι.