Lo primero que tienes que hacer es hidratar la soya.

Cocer los jitomates y el ajo, si tus chipotles son secos también agregarlos a la cocción pero si son de lata resérvalos. 

Ya cocidos ponlos en la licuadora hasta obtener un puré fino y espeso, trata de no agregarle mucha agua de la cocción. 

Filetea la cebolla y en una cacerola con un poco de aceite acitronala (hasta que este translúcida).

Inmediatamente agrega la soya y salteala unos momentos, esté es el momento adecuado para condimentar, agrega sal y pimienta a tu gusto saltea por unos minutos .

Agrega el puré que habías reservado previamente colado y si tus chiles son de lata agregalos en este momento también,  deja hervir por 10 min mas y rectifica el sazón. (esto quiere decir que te asegures que está bien de sal y pimienta).