Πλένουμε πολύ καλά και ξεφλουδίζουμε τα κυδώνια. Παίρνουμε τις φλούδες και τις καρδιές και τις δένουμε μέσα σε ένα τουλπανι. Τρίβουμε τα κυδώνια στο λεπτό του τρίφτη (μην φοβηθειτε αν σας μαυρίσει θα ξεμαυρισει στο βράσιμο 😉) εγώ τα ετριψα (το μπελαλιδικο σημείο 😁) αμέσως μέσα στην κατσαρόλα.

Βάζουμε σε κατσαρόλα το τριμμένο κυδώνι, το τουλπανι με τις φλούδες και το νερό, αφήνουμε να πάρει βράση και μόλις πάρει βράση τα αφήνουμε να βράσουν για 15'. Μόλις περάσει ο χρόνος αφαιρούμε το τουλπανι με τις φλούδες και το στύβουμε όσο μπορούμε κρατάμε τον ζωμό που θα βγάλουν και τον τοποθετούμε μέσα στην κατσαρόλα και μετά πετάμε το τουλπάνι, προσθέτουμε στην κατσαρόλα μας την ζάχαρη, το ξύσμα λεμονιού και τη βανίλια και συνεχίζουμε το βράσιμο για 45' ακόμα σε μέτρια φωτιά.

Ανακατεύουμε με ξύλινη κουτάλα τακτικά και θα δούμε πως όσο περνάει η ώρα και καραμελωνει η ζάχαρη μας η μαρμελάδα μας θα πάρει ένα ροζ απαλό χρώμα. Στα τελευταία 5' προσθέτουμε και τον χυμό λεμονιού και αφήνουμε να κρυώσει.

Αποστειρωνουμε τα βάζα μας πλένοντας τα σε ζεστό σχεδόν καυτό νερό και μετά τα βάζουμε στον φούρνο μας στους 200° βαθμούς για 10'(αυτή την διαδικασία μπορούμε να την κάνουμε όση ώρα βράζει η μαρμελάδα μας για να τα έχουμε έτοιμα μόλις κρυώσει η μαρμελάδα μας και να την βάλουμε μέσα).