Πλένουμε καλά τα κολοκυθάκια, κόβουμε τις άκρες και τα τρίβουμε στο ψιλό μέρος του τρίφτη. Αφού το κάνουμε αυτό, βάζουμε το τριμμένο κολοκύθι σε μια πετσέτα και το τυλίγουμε. Ζουπάμε πολύ για να βγάλει τα ζουμιά του.Έπειτα το βάζουμε σε ένα σουρωτήρι (για τα μακαρόνια που στραγγίζουμε) και το αφήνουμε στην άκρη για να βγάλει ότι ζουμιά έχει ακόμη. Τσιγαρίζουμε τα κρεμμύδια σε ένα αντικολλητικό τηγάνι και όταν αλλάξουν χρώμα τα αφαιρούμε από την φωτιά και αφήνουμε κι αυτά στην άκρη.

Προθέρμανση φούρνου (περίπου 15 λεπτά πριν βάλουμε την πίτα) στους 180 βαθμούς, αντιστάσεις.

Στο ταψί που θα χρησιμοποιηθεί, πασπαλίζουμε με λίγο ελαιόλαδο, και ρίχνουμε τη μισή φρυγανιά από πάνω (η υπόλοιπη μπαίνει μέσα στο μείγμα)
Σε ένα μπολ, ρίχνουμε όλα μας τα υλικά, ανακατεύουμε καλά και ρίχνουμε το μείγμα στο ταψί. Ψήνουμε μέχρι να ροδίσει η πίτα, περίπου 30-35 λεπτά ανάλογα τον φούρνο.