ขั้นแรก เตรียมไส้ ใช้ไฟกลาง ใส่น้ำตาลพร้าวลงไป พอละลาย แล้วเทมะพร้าวขูดตามลงไป (แบ่งมะพร้าวไว้สัก 10 กรัม เอาไปนึ่งไว้คลุกกับขนมตอนสุดท้าย) ผัดให้เข้ากันหมาดๆ (หรือแห้งเลยจะดี) ตักขึ้นมาพักไว้ เป็นไส้ขนม

ต่อมา เตรียมแป้ง โดยแบ่งแป้ง เป็น 2 ส่วน กะทิ 2 ส่วน ส่วนแรกใช้แป้งข้าวเหนียวผสมกับกะทิได้แป้งขนมต้มสีขาว ส่วนที่สองเพิ่มน้ำอัญชัน เหยาะน้ำมะนาวลงไปพอเปลี่ยนสีเป็นสีม่วง ผสมเข้าไปด้วยจะได้แป้งขนมต้มออกสีม่วง

สุดท้าย นำขนมที่เตรียมไว้ลงไปต้มในน้ำเดือด ประมาณ 20 นาที หรือจนกว่าจะสุก โดยสังเกตจาก ลูกไหนที่ลอยขึ้นมาคือสุกดีแล้ว ส่วนมะพร้าวขูดที่แบ่งไว้ตอนแรกนำมาคลุกเกลือเล็กน้อยแล้วเอาไปนึ่งสัก 10 นาที ไว้สำหรับคลุกกับขนมต้มกินเป็นอันเสร็จ ขนมต้มลงจานพร้อมเสิร์ฟแล้วจ้า