Bắc chảo lên bếp đảo gia vị nấu phở với lửa vừa rồi giã nhỏ (trừ hạt tiêu và hạt mùi). Cho vào túi lọc để nấu nước dùng.

Cho xương, hành tây, hành tím, gừng, túi gia vị nấu phở vào nồi cùng 3 lít nước đã xả bớt clo và vắt thêm chanh (tạo nước kiềm để ninh xương ngọt hơn - phương pháp nấu ăn của người Nhật), muối và đường phèn vào nồi áp suất ninh 20p.

Trong thời gian ninh xương thì luộc phở. Phở ngâm mềm, đun nước sôi thả phở vào luộc 2-3 phút, phở chín vớt ra xả nước lạnh để nguội.
Sau đó thái mỏng thịt bò mềm, cất tủ lạnh, bao giờ ăn mới lấy ra.

Nước dùng ninh xong vớt bỏ hành tây, hành tím, gừng và túi gia vị, cho rễ mùi và rễ hành vào hầm chung 20p. Vớt bỏ rễ hành và rễ mùi. Đợi nước nguội mới nêm nước mắm để nước dùng k bị chua.
Vớt gân bò ra thái miếng vừa ăn.
Hành chẻ sợi, cọng hành cắt nhỏ.

Bắc nồi lên bếp đun sôi nước dùng. Sắp phở, thịt bò, gân bò, hành chẻ và hành thái nhỏ và tô, có thể thêm giá nếu thích. Nước dùng sôi chan vào tô phở. Dùng ngay khi còn nóng cùng rau thơm.