Ngâm gừng trong khoảng 20 phút rồi rửa sạch lớp đất, cát bám trên bề mặt vỏ. Dùng dao cạo đi lớp vỏ bên ngoài và thái thành những lát thật mỏng (hoặc dùng dụng cụ nạo vỏ hoa quả để nạo gừng thành những lát mỏng). Vừa thái vừa ngâm vào thau nước có pha sẵn 2 thìa muối, sau đó vớt ra rổ để ráo nước. Cho gừng vào nồi, đổ ngập nước, đặt nồi lên bếp đun sôi gừng trong khoảng 2-3 phút. Sau đó chắt bỏ nước luộc gừng rồi lại cho nước mới vào luộc. Đun sôi lần 2 như thế thì món mứt gừng sẽ bớt đi vị cay.

Khi nước vừa sôi ở lần thứ 2 thì hãy vắt vào nồi nước luộc gừng một quả chanh để gừng được trắng đẹp hơn.

Vớt gừng ra và rửa lại với nước sạch nhiều lần (2-3 lần) để loại bỏ đi vị chua của chanh. Sau đó, ướp gừng với đường. Để đường tan hoàn toàn rồi mới sên mứt.

Bắc chảo lên bếp, đợi chảo nóng già rồi cho hỗn hợp đường và gừng vào, đun với lửa vừa.
Thỉnh thoảng dùng đũa đảo đều để gừng không bị cháy sém và được ngấm đường. Đến khi lượng nước đường trong chảo không còn nhiều và đã hơi sền sệt thì giảm nhỏ lửa, dùng đũa đảo liên tục và cho vanilla vào để tạo mùi thơm.
Khi đường trắng kết tinh bám vào gừng thì nhanh tay bắc chảo xuống bếp.

Mứt gừng có hạn dùng lâu nhất trong các loại mứt.
Khi mứt đã nguội hẳn thì nên sử dụng lọ thủy tinh hoặc buộc kín túi nilon để bảo quản mứt được lâu, trong thời gian dài, mứt gừng có hạn sử dụng lâu nhất trong số các loại mứt. Tuy nhiên, nên tránh để mứt tiếp xúc với không khí dễ gây mốc, hỏng.