Προθερμαίνω το φούρνο στους 180 βαθμούς κελσίου.

Σε φαρδύ τηγάνι βάζουμε λάδι, σκόρδο, κρεμμύδι και θυμάρι και τα ανακατεύουμε όλα μαζί για 2 λεπτά. Κατόπιν προσθέτουμε και το σπανάκι και το αφήνουμε να ψηθεί για λίγο και να χάσει κάπως τα υγρά του και τον όγκο του.

Κατόπιν έρχεται η σειρά του τραχανά. Τον τοποθετούμε στο σκεύος μαζί με το νερό και ανακατεύουμε για 3-4 λεπτά μέχρι να μαλακώσει ο τραχανάς.

Σε ένα μπολ βάζουμε τα αυγά, τη φέτα, τον άνηθο και το δυόσμο και ανακατεύουμε.

Αδειάζουμε τα υλικά του τηγανιού μέσα στο μπολ και ανακατεύουμε.

Λαδώνουμε ένα ταψί μεγέθους 32 εκ. και απλώνουμε τη φρυγανιά.

Αδειάζουμε το μείγμα μέσα στο ταψί και στρώνουμε την επιφάνεια. Από πάνω βάζουμε το τριμμένο τυρί και φουρνιζουμε.

Ψήνουμε στους 180 βαθμούς κελσίου για μία ώρα ή μέχρι να ροδίσει η επιφάνεια.