แช่ในน้ำเปล่า (ดื่ม) เป็นเวลา 24 ชม. (ภายใน 2-3 ชม.แรก ถั่วจะขยายตัวเกือบเท่าตัว จากการดูดซับน้ำเข้าไปครับ เมื่อเวลาผ่านไป จะเริ่มมีฟองลอยเหนือน้ำและกลิ่นเริ่มแรงขึ้น ไม่ต้องกังวลว่าถั่วจะเน่าเสียครับ ที่ผมทำ ฟองฟอดปิดผิวน้ำหมดเลยครับ)

เมื่อครบ 24 ชม. ให้เทน้ำออกแล้วล้างผ่านน้ำครับ

ตั้งหม้อความดันต้มน้ำให้เดือด พอทำการนึ่งถั่วที่เราล้างเสร็จแล้วในขั้นตอนถัดไปครับ

เมื่อน้ำเดือดแล้ว ให้นำถั่วลงไป ปิดฝาดำเนินการนึ่ง ประมาน 10 นาที แบบยังไม่ใช้ตัวช่วยเพิ่มแรงดันครับ โดนลดไฟลงมาเป็นไฟแรงปานกลาง พอที่จะให้น้ำเดือดขึ้นมาเป็นไอน้ำนึ่งถั่วของเราได้ครับ

หลังผ่านไป 10 นาที ให้ใช้ตัวช่วยเพิ่มแรงดันครับ หลังจากนั้น (ภายใน 5นาที) เมื่อไอน้ำเริ่มดันออกจากรูระบายแรงดัน ให้นึ่งต่อไปอีก 40 นาทีครับ

หลังนึ่งครบ 40 นาทีท้าย ให้ปิดเตาไฟ แล้วรอให้แรงดันจากหมอหายไปก่อนประมาน 5-10 นาที (สังเกตจากเสียงไอน้ำจะหายไป แล้วรออีกสักพักเพื่อความปลอดภัยเวลาเปิดหม้อแรงดันจะได้ไม่ระเบิดใส่หน้าครับ)

นำถั่วที่นึงเสร็จแล้วเทใส่ถาดที่เตรียมไว้ครับ (ควรหาถาดที่ใหญ่พอที่จะไม่ให้ถั่วเรียงทับกันสูงเกิน นิ้วถึงนิ้วครึ่งครับ) ปล.สามารถสังเกตได้ว่าถั่วที่สุกแล้วสีจะออกคล้ำๆครับ และสามารถใช้นิ้วบีบถั่วให้แตกเละได้ไม่ยากมากตามภาพครับ

พักให้ถั่วเย็นลง ในระดับอุ่นๆพอที่เราสามารถจับได้ไม่ลวกมือครับ (ประมาน 45 c)

นำหัวเชื้อนัตโตะมาหนึ่งกล่อง (ขนาดบรรจุที่ขายตามซุปเปอร์อยู่ที่ประมาน 10-15 กรัมต่อ 1 กล่องเล็กๆครับ) ลงไปผสมกับถั่วที่พักให้หายร้อนแล้ว พร้อมกับตักน้ำก้นหม้อนึ่งลงไปสัก 3-4 ช้อนกลาง เพื่อเพิ่มความชุ่มชื้นระหว่างการบ่มนัตโตะครับ แล้วคลุกเคล้าถั่วและนัตโตหัวเชื้อเข้าด้วยกันให้ทั่วครับ

นำแผ่นพลาสติกห่ออาหารแผ่นที่ 1 มาวางแผ่แนบลงไปบนตัวถั่วของเราเพื่อรักษาความชุ่มชื้น แล้วใช้ไม้จิ้มฟันเจาะรูไว้ เพื่อให้แบคทีเรียดีที่ทำการบ่มของเรามีอากาศถ่ายเทครับ นำแผ่นพลาสติกห่ออาหารแผนที่สอง หุ้มถาดด้านบนไว้ พร้อมเจาะรู เหมือนแผ่นแรกครับ หารทำเช่นนี้จะทำให้มีช่องอากาศระหว่างแผ่นที่ 1 และ 2 เพื่อไม่ให้ถั่วที่เราบ่มถูกอากาศภายนอกโดยตรงทันทีทันใดครับ

ทิ้งบ่มไว้ในอุณหภูมิห้อง 24-48 ชม. ครับ (หลังผ่านไป 12 ชม. จะเริ่มเห็นวงๆขาวๆรอบๆถั่ว และกลิ่นจะเริ่มแรงขึ้นเรื่อยๆครับ และสังเกตครับว่าอุณหภูมิของภาชนะที่ทำการบ่มจะอุ่นอยู่เสมอ เป็นความร้อนจากการบ่มครับ)

เมื่อบ่มได้ที่ (อย่างน้อย 24 ชม.) ให้ทำการเก็บเข้าภาชนะเช่นขวดโหลแก้ว/เซรามิกครับ แล้วเก็บเข้าตู้เย็นสัก 1 คืนให้นัตโตะที่เราบ่มเสร็จได้พักครับ ซึ่งจะทำให้กลิ่นฉุนจากแอมโมเนียลดลง และรสชาติดีขึ้นครับ

ขั้นตอนการเตรียมซอสราดนัตโตะ ให้นำซีอิ๊วขาว น้ำ และน้ำตาลลงไปตั้งเตาให้เดือด น้ำตาลละลายแล้วปิดเตา แล้วนำไปแช่เย็นครับ

การเตรียมทานนัตโตะ ให้นำนัตโตะออกมารับประทานทีนึงประมาน 2-4 ช้อนกลางพอครับ แล้วราดซอสที่เตรียมไว้ลงไปให้นัตโตะของเราพอเปียกครับ (ประมาน 1 ช้อนกลางครับ) และใส่มัสตาร์ด (เดจองมัสตาร์ด มันตาร์ดญี่ปุ่น หรืออื่นๆที่คล้ายคลึงกัน) ประมานปลายช้อนกาแฟพอ แล้วใช้ตะเกียบคนๆหมุนๆไปครับ ก่อนนำไปรับประทานกับข้าวสวยร้อนๆ หรือว่าจะทานเล่นกลับแกล้มได้ครับ