醤油は煮立たせないほうがよい気がしますが、学生時代調理実習で日本料理の先生が、沸騰させると生臭さがなくなるとおっしゃっていたので、それ以来醤油物は一瞬でも沸騰させてます。
それでも気になるときは、生姜を入れたり、白髪葱を入れたりしてます。