Volcar la harina sobre un bol, hacer un agujero grande en el centro de la harina e incorporar en su interior la levadura disuelta en el agua, el aceite y algo de sal, amasar bien hasta obtener una mezcla homogénea y elástica, dejar reposar la masa en un lugar templado de la casa durante 30 minutos.

Pelar las cebollas y cortarlas junto con los pimientos en tiras finas que rehogaremos en una sartén hasta dorar, agregar el calabacín también cortado en tiras y el perejil picado, y freír durante 8 minutos a fuego medio, después incorporar los tomates pelados y picados, sazonar y dejar reducir todo durante 5 minutos más.

Saltear los berberechos en una sartén con algo de aceite hasta que se abran, separar la carne de las valvas, pelar los huevos duros y cortarlos en láminas, estirar una porción de la masa en forma rectangular con un grosor de 3 mm, repartir sobre ella el sofrito, los huevos en lonchas y los berberechos, cubrir con la otra mitad de masa estirada, cerrar los bordes y pintar con huevo, hornear a 190 °C durante 15 minutos.

Dejar enfriar la empanada y trocearla en porciones, se puede acompañar de una salsa de tomate casera y ligera.